Manajemen pesantren di Indonesia merupakan salah satu pengembangan pesantren di masa depan guna melestarikan keberagamannya yang ada di Indonesia guna dapat mencirikan pesantren yang ada di Indonesia bersifat Pesantren yang kompetitip dan bermartabat sehingga dapat memberikan kontribusi bagi perkembangan kajian pesantren studies di Indonesia. Model kepemimpinan Kiai Pesantren ala Gus Mus merupakan penelitian yang secara spesifik meneliti tentang peran para kiai di pesantren di Indonesia. Bahasan umum pada penelitian ini adalah manajemen di pesantren dan secara khusus adalah gaya kepemimpnan KH. Mustofa Bisri di pesantren Raudhatut Thalibin Rembang atau dikenal kota santri di jawa tengah. Sehingga melalui buku ini pembaca mendapatkan model manajemen KH Mustofa bisri dalam mengelola pesantren yang diasuhnya.